Criaturas muy inteligentes y sociales, las mantarrayas gigantes en algunas regiones pasan el día en grandes grupos y en estaciones de limpieza en aguas poco profundas y luego se trasladan a aguas más profundas por la noche para alimentarse. Suelen coincidir con agregaciones de tiburones ballena, ya que ambas especies se alimentan del zooplancton altamente concentrado producido por los eventos de desove de peces e invertebrados. Las mantas utilizan un aparato de alimentación filtrante altamente especializado que filtra el plancton del agua de mar mientras nadan. Este aparato permite que las partículas más grandes reboten desde las branquias hasta el estómago y resiste la obstrucción de elementos no deseados. En el océano Atlántico central occidental, descubrimos que sus hábitats preferidos son principalmente costeros en zonas de alta productividad primaria, como las desembocaduras de los ríos. Las mantas gigantes se encuentran entre las especies de rayas menos productivas en cuanto a su rendimiento reproductivo, y se estima que una sola hembra sólo puede producir entre 4 y 7 crías en su vida. El valioso comercio de sus branquias ha provocado un aumento de la demanda de manta raya gigante, y algunas pesquerías han empezado a capturarlas, cuando antes sólo lo hacían de forma incidental. Debido a su baja tasa de reproducción, la especie tardaría mucho tiempo en recuperarse de la sobreexplotación.